En el costado derecho de la galería anterior se abre el patio principal del palacio, el cual contaba con arcadas en sus costados, de las cuales aún se pueden reconocer sus trazas en la franja meridional conservada. El cierre del patio por el norte es el muro U.E.M. 4, un largo paramento que se une, sin solución de continuidad, con U.E.M. 5, conformando hacia el norte una estancia que en el plano de Praves se señala como oficinas, que ocupaban la panda septentrional, y que con bastante probabilidad debió emplearse como bodega, dada la profundidad que alcanza desde la cota de calle en la zona de fachada del palacio (aproximadamente unos 7,5 m, que van desde los 696,32 m s.n.m en la calle Cadenas de San Gregorio y los 688,86 m s.n.m. en la base del lienzo señalado). La galería norte del patio, que aún se conserva en la trasera de la Casa del Sol, es diseñada y ejecutada por Diego de Praves en 1612, dentro de las reformas planteadas con la nueva propiedad del conde de Gondomar.

Siguiendo con la excavación, hacia el este de U.E.M. 5 (que se corresponde con el muro que se descubrió en el sondeo 2 del año 2021), en la misma trayectoria que U.E.M. 4, se documenta el muro U.E.M. 3, el cual creemos que se puede equiparar con la zona de conexión entre el patio principal y el corral situado al norte. Según el dibujo de Praves, en ese punto habría una puerta y los hallazgos arqueológicos parecen confirmar esa circunstancia, por cuanto el paramento hallado presenta un rebaje en su parte central, justo en un punto de debilidad constructiva, ya que tiene una gran diaclasa vertical, que pudo estar provocada por la debilidad estructural de esta zona o por la reforma de este punto con el paso del tiempo. Otro aspecto que avala esa hipótesis es la pequeña columna de sillares calizos cuadrados que está adosada al lateral oriental de U.E.M. 5 y que parece tratarse de una de las jambas verticales del acceso aquí creado. El muro U.E.M. 2, perpendicular a U.E.M. 3, cerraría este costado y sería el que aparece representado en el plano de Praves, discurriendo desde la Casa del Cura hasta el corral más oriental. Por tanto, todos los paramentos señalados hasta aquí corresponden a la estructura original del palacio renacentista, fechándose con bastante probabilidad en la segunda mitad del siglo XVI.

La fisonomía de la zona norte del patio, y su conexión con los corrales que llegan hasta la propia Rondilla de Santa Teresa, que se aprecia en el plano de 1595, es bastante probable que se modificara con el paso del tiempo, ya que por el desarrollo sesgado de los muros U.E.M. 2 y 5 puede señalarse que en ese punto se levantase una galería paralela a la de poniente en este lateral, eso sí, parece que con un menor desarrollo y volumetría, tanto en longitud hacia el norte como en altura. Así, parece observarse en la fotografía del vuelo de 1940 y en la de la colección RAF de 1953-1955, aunque en este segundo caso con una visión dificultosa para esta zona del convento en ese momento. Por su parte, el aljibe U.E.M. 1, hallado en el extremo más oriental de la intervención, que se apoya y secciona a U.E.M. 2, es de una clara cronología contemporánea, vinculándose a la construcción del edificio de 1980.

A partir de 1912, cuando las monjas acogen la propiedad del inmueble, se lleva a cabo una profunda reforma de las construcciones palaciegas de los siglos XVI y XVII y se acomodan a las necesidades del convento. Las trazas que se observan aún hoy en el patio, en sus costados este, norte y sur, reflejan modificaciones intensas y añadidos a las pandas palaciegas originales, como es el caso de la unida a la crujía occidental y la que se desarrollaba a partir de la casa del cura hacia el norte, que debería relacionarse con la galería oriental que antes señalábamos.

A partir de los años 60 del siglo XX se asiste a un nuevo periodo de grandes obras en este emplazamiento, debido tanto a la implantación desde 1966 de un colegio de enseñanza primaria como a la completa reforma de la residencia de las monjas y de las personas que acogían, principalmente mujeres con diversos problemas. De esta forma, en 1965 se construye el edificio para las nuevas escuelas (AMVA, Expte. 198/1965); en 1970 se construye la residencia femenina que se abrirá en 1972 (Expte. 44/1970 y 487/1970), y entre 1976 y 1978 se redactan los proyectos para la ordenación de espacios y la construcción del edificio de la comunidad religiosa, a la vez que se realiza una segregación de la parcela original (Expte. 157/1977 y 487/1972), construcción que se inscribiría en el Catastro, una vez concluido, en 1980. En paralelo, hay diferentes expedientes relativos a las nuevas alineaciones de la calle Rondilla de Santa Teresa, vinculados al trazado definitivo de ella y a la delimitación de la propiedad de las religiosas (1969 y 1977).

Las actuaciones efectuadas en el solar en el siglo XX desfiguraron completamente los restos precedentes del palacio e incidieron de forma severa en su conservación. La propia construcción del edificio de 1980, con un sótano para aparcamiento de vehículos cuya excavación llegó a alcanzar en algunos puntos los 6 y 7 m bajo la cota de calle para colocar sus las cimentaciones, completó la alteración de la franja norte del antiguo conjunto palaciego. Sólo se conservó, y de aquella forma, los tramos de muros que se encontraban a mayor profundidad y dispuestos en la medianería con el solar de la Casa del Sol, que se desgajó del resto en 1980 tras ser adquirido por los Padres Mercedarios Descalzos, para posteriormente pasar a manos del Estado en 1999. De ahí que los paramentos hallados en la excavación están seccionados por las obras ejecutadas entre 1978 y 1980, tal y como reflejan los cortes en cascada de U.E.M. 2, 5, 6, 7 y 8. Por su parte los de mayor envergadura, como U.E.M 3 y, sobre todo, U.E.M. 4, se conservaron con una mayor consistencia al emplearse como refuerzo y apoyo de la cimentación lateral del sótano del inmueble levantado entonces. Asimismo, y para desgracia del registro arqueológico, tal y como se señalaba en párrafos anteriores, los sedimentos documentados junto a los muros no tienen nada que ver con los momentos de erección y uso, sino que responden a fases relativamente recientes de abandono y colmatación de estos espacios.